第二种自由，就是思想和观点的自由，伊斯兰教鼓励人们观察和思考宇宙万物。真主说：“你说：‘我只以一件事劝导你们，你们应当为真主而双双地或单独地站起来，然后思维。…’”（古兰34:36）又说：“你说：‘你们应当观察天地间的森林万物。’”(古兰10:101)又说：“难道他们没有在大地卜旅行，因而有心可以了解，或有耳可以听闻吗？因为肉眼不盲，胸中的心眼却盲了。”（古兰22:46）伊斯兰在痛斥专事猜测的人时说：“猜测对于真理，确是毫无裨益的。”（占兰53:28）伊斯兰唾弃那些放纵私欲，因袭祖先或盲从领袖和伟人之流。《古兰经》指责这类人，他们在复活日将说：“他们说：‘我们的主啊！我们确已服从我们的领袖和我们的伟人，是他们使我们违背正道。’”（古兰33:67）这些人他们怨恨说：“不然，他们说：‘我们确已发现我们的祖先是信奉一种宗教的，我们确是遵循他们的遗迹而得正道的。’”（古兰43:22）伊斯兰认为，这样的人仿佛畜类，或更迷误。《古兰经》斥责因循守旧，敦促人们勤于观察和理智思考。真主说：“如果你们是诚实的，那么，你们就拿出证据来吧！”（古兰：2: 11）伊斯兰在确定信仰时，首先依靠的是理性证据：因此，穆斯林学者们常说：“理智是启示的基础，”即正常的理智是理解经训的基础。真主的实有问题，首先是以理智确定的，穆圣是圣的问题，也是以理智确定的。理智可以断定，这就是使者，因为有证据证明他的诚实，各种感应——证明他诚实的奇迹，可以证明他被委为先知的真实性；理智也可以断定：这是个撒谎者，因为他没有证据，也没有感应。这就是伊斯兰对理智思考的重视和尊重。

    因此，在伊斯兰教中出现了思想和学术的自由。我们发现各学派之间尽管存在分歧，甚至相互反驳，但彼此之间没有芥蒂和攻击。我们通常会发现一部教法专著中溶入各学派的不同观点，供人选择，彼此借鉴，吸取精华。这充分体现了学者们的博大胸怀，也证明了伊斯兰在思想和学术方面的自由。

   伊斯兰鼓励并规定人有针砭时弊的自由。而且当这种言论关系到民族和人民的利益，以及社会道德问题时，那么这种自由将从一种权利转变为一种应尽的义务。即你应当说真话，而不要害怕任何人的威胁；应当劝善戒恶，维护正义，导人于正道；应该敢于对行善者说：你行善了：对犯罪的人说：你犯罪了。如果没有人履行这一义务，或你的沉默会造成对民族和公众的损害，那么，敢言和真言就从一种权利转变为一种义务。此时的你就应该直言、言真，不要怕自身的安危。“你应当劝善戒恶，应当忍受患难，这确实应该决心做的事情。”（古兰31:17）这就是伊斯兰致力达到的目标。伊斯兰不会让人忍气吞声，瞻前顾后，因而不敢直言，言真，甚至不敢申明自己的信仰。正如法老对他的魔术师们说：“没有获得我的许可，你们怎么就信仰了他呢？”(古兰7：123)不经他许可，他不想要人们信仰；未经上级默许，人们不敢直言。

    伊斯兰不仅给人们带来了思维与参悟的自由，而且命令他们思考；允许他们信仰自己认准的真理，还责成他们信仰自己确定的真理，并且让有信仰的人用武力捍为自己的信仰；命令穆斯林拿起武器捍卫自由——宗教信仰自由，反对压迫，直至祸患压迫消除，宗教只归真主。因此，真主说：“被进攻者，已获得反抗的许可。因为他们是受压迫的。……要不是真主以世人相互抵抗，那么许多修道院、礼拜堂、犹太会堂、清真寺——其中常有人纪念真主的建筑物——必定被毁坏。”（古兰22:39）即如果真主没有制定穆斯林以武力捍卫信仰自由以及人权自由，那么就没有人在大地上崇拜真主，也不会存在什么基督教堂、礼拜堂和清真寺，以及所有记念真主的地方。这就是伊斯兰，它给人类带来了自由——权利的自由．而不是背叛和作恶的自由，也不是人们今天所标榜和叫嚣的个人主义和享受主义自由。即个人可以自由通奸、自由酗酒、自由犯罪。然而对关系到某些权益，就没有自由了。你不能针砭时弊，说真心话，不能对行善者说：你行善了。不敢对瘸子说：你是个瘸子。不……你只有个人的自由，自由地自我作茧，白由地堕落，自由地破坏自己和别人的家庭。你享有这一切的自由。如果这就是自由的内含，那么，伊斯兰不认可这样的自由。因为这是作恶的自由，而不是权利的自由 伊斯兰所确定和维护的自由是思想自由、学术自由、观点自由、言论自由、宗教信仰自由。这就是人们赖以生存的自由。你个人行为自由，但不得损害他人：你所有权自由，但要以合法所得，不得自我伤害和伤害别人。这就是伊斯兰的基本原则。“不得自我伤害，伤害别人。”——圣训。给别人和他人造成伤害的任何自由，都应该制止，应该受到限制，因为你的自由已经侵犯了他人的权利。你追求自由却践踏了别人，这种损人利己的所谓自由是为人所不齿的。你有权自由地行路，但要遵守交通规则，不得与人、车相撞，伤害路人，违反交通规则。对你自由的这一限制，是要你遇红灯时停步或往右转等等。这种限制实际上是一种公益行为。每一个宗教，每一种制度都免不了这样的限制。这就是伊斯兰带来的自由，是人类所达到的最合理的自由。