南京市净觉寺
地址：江苏省南京市升州路28号
邮编：210000
该寺亦名三山街礼拜寺。明洪武年间（1368—1399年）敕建，不久被焚毁．宣德五年（1430年）三保太监郑和奏准重建。弘治五年（1492年）重修。嘉靖年间（1522—1566年）世宗敕赐“净觉寺”匾额并建牌坊1座、相传该寺在明代建筑范围不少于40亩。清代以来迭经出售、出租和拆建马路，仅余6.54亩。太平天国初期被拆毁。同治前后穆民集资重建，民国初年蒋秀冬氏捐建南北讲堂及楼厅，1957年再修。“文革”中为工厂占用，原仅存的明代建筑砖石牌坊被拆除，匾联、碑石幸存者不多。宗教政策恢复后重新开放，1982年、1984年政府拨款修葺、重建一新。现寺建筑总面积165o平方米，寺门临街南开，门内迎面为新建复原明代牌坊。院内分两进，最前为望月楼，有楼厅3间，带前廊，背朝前作倒座形式，稍后两侧为南北讲堂各3间。仪门为圆月形，后进中央是正厅，面阔、进深各3间，厅后为大殿，二者以廊相连，平面是工字形，礼拜大殿为中国宫殿式，建筑面积348．7平方米，可容400余人同时聚礼，为南京各清真寺之冠，门额悬“正心诚意”匾，为“民国十一年六月南京回教联合会会长暨会员敬立”。寺内另有附房17间。该寺地处要地，历代均有著名经师出教传学，清初王岱舆、刘介廉、伍遵契、马君实等先贤先后在此译经讲道。民国年间金永兴阿旬与外籍基督教传教士李嘉白公开论战，颇为著名。该寺还曾先后是“南京市回教联合会”、“中华回教公会”及其南京筹备委员会、大道报》社等全国性及地方伊斯兰教机构所在地。本坊教民素以“新行”著称，但奉行亦不彻底。

南京市太平路清真寺
地址：江苏省南京市大平南路298号
邮编：210000
该寺原名花牌楼礼拜寺，创建于明初洪武年间（1368——1399年），原址在户部园，太平天国时期被毁、后由乡老集资建简易寺房．1924年坊内富绅蒋氏因老寺已破陋不堪，相对邻近的基督教青年会西式洋房，对比鲜明，时有内疚，乃合资3万银元在新址建寺，穆斯林称之为“争气寺”。1945年抗战胜利后，蒋氏出资修理大殿。新中国成立后政府拨款于1953年、1959年、1980年三次修葺。据当地乡老相传，明建寺寺宇宏伟，巳不知其详。新寺原为三进，首进迎街为面阔5间的阿拉伯式汉白玉门楼（上为邦克楼），为全寺精华，1931年因扩建马路被拆除。二进为单檐硬山顶式大厅，前后有廊；第三进为礼拜大殿，建筑面积189平方米。北院有水房和南北向的中式楼房，为小经堂、阿訇坐卧室及办公用房。其建筑质量和细部工艺十分出众．著名经师李廷相于1925——1931年任教该寺，胡恩钧于1945—1948年任教该寺。民国年间寺产、租金除供寺内开支和维修费外，还从事助学、奖学和慈善救济事业。本坊教民属老格迪目。

南京市草桥清真寺
地址：江苏省南京市打钉巷20号
邮编 210004
该寺位于南京市原草桥瑰，以此得名、始建于清乾隆年间（1736年一1795年），太平天国时毁于兵火。同治初年，由马伊玛目和学董沙姓募捐重建。大殿5间，为古典民殿式，南北讲经堂6间、净水堂3间，附属房屋2间，均为平房。该寺地处回民聚居区七家湾，教民人数之多为各寺之首，所聘教长多为名流。该寺曾于民国初年创办敦穆小学，首任校长为易于芳。寺在“文革”时一度被工厂占用，收回后，因坏损严重，又曾暂租给南京木器厂使用，现正在恢复中。

南京市汉西门清真寺
地址：江苏省南京市堂子街汉西门礼拜寺巷13号
邮编 210004
该寺约创建于明天启、崇越年间，占地面积约为4.2亩。太平天国时期毁废。清同治年间（1862—1874年）复建简易房屋，恢复礼拜。1915年左右，马延树（榕轩）集资重建大殿。后又续建牌坊、望月楼、净水堂、讲经堂、宿舍等房屋。大殿面积为32O平方米，高约8米，为中国古典房殿式建筑，但围墙与门窗系阿拉伯式，设计大胆，结构紧凑。该寺曾设立私立崇穆小学。寺内及小学费用，部分来自马廷树在夫子店购置房地产出租所得之租金。1918年马氏以汉西门清真寺为首坊，成立南京市清真寺董事会，马廷树被公举为会长，领导全市清真寺教务、寺产和回族公益事业。1924年马延树逝世，董事会也渐次衰落，后更董事会为“道圣堂”、该寺著名教长有马真吾、袁盛之、马进益、袁汝涛等。寺在“文革”中被拆除，现尚未完全恢复。